De acordo com o iBOL (International Barcode of Life Project - https://ibol.org/about-us/what-is-dna-barcoding/), DNA barcoding foi criado para chamar a atenção da comunidade científica, quando em 2003 o grupo de pesquisa de Paul Hebert da Universidade de Guelph publicou o artigo científico Biological identifications through DNA barcodes. Neste artigo, eles propuseram um novo sistema de identificação e descobrimento de espécies utilizando um pequeno trecho de DNA de uma região padronizada do genoma. Essa sequencia de DNA pode ser usada para identificar diferentes espécies, da mesma maneira que um scanner de supermercado usa as listras pretas do código de barras UPC (Universal Product Code) para identificar suas compras.

A região do gene que está sendo usado por quase todos os grupos de animais é de 648 pb do gene mitocondrial citocromo c oxidase 1 ("CO1"), e está se mostrando altamente eficaz na identificação de pássaros, borboletas, peixes, moscas e outros grupos de animais. A vantagem de usar COI é que a região é curta o suficiente para ser sequenciada de forma rápida e barata e ainda longa o suficiente para identificar variações entre as espécies.

O código de barras COI não é eficaz para a identificação de plantas, pois elas evoluem muito lentamente, mas duas regiões do gene no cloroplasto, matK e rbcL, foram aprovadas como as regiões de código de barras para as plantas terrestres.

Fonte:BrBOL Brasilian Barcode of Life                                                                                           https://brbol.org/pt-br/content/o-que-%C3%A9-dna-barcoding